Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab3bQ9CZT8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rab3bQ9CZT8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rab3bQ9CZT8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms