Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp11Q9CZJ1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp11Q9CZJ1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp11Q9CZJ1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp11Q9CZJ1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp11Q9CZJ1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp11Q9CZJ1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp11Q9CZJ1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp11Q9CZJ1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp11Q9CZJ1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp11Q9CZJ1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp11Q9CZJ1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp11Q9CZJ1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp11Q9CZJ1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp11Q9CZJ1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp11Q9CZJ1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Utp11Q9CZJ1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Utp11Q9CZJ1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Utp11Q9CZJ1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Utp11Q9CZJ1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Utp11Q9CZJ1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Utp11Q9CZJ1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp11Q9CZJ1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms