Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY28

Gtpbp8, GTP-binding protein 8, mousemouse

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp8Q9CY28 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Gtpbp8Q9CY28 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtpbp8Q9CY28 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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