Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
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