Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RpainQ9CWY9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
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