Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxxc1Q9CWW7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms