Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Prkrip1Q9CWV6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms