Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot11Q9CWN7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms