Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWH6

Psma8, Proteasome subunit alpha type-7-like, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma8Q9CWH6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma8Q9CWH6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma8Q9CWH6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma8Q9CWH6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma8Q9CWH6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma8Q9CWH6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma8Q9CWH6 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma8Q9CWH6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma8Q9CWH6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma8Q9CWH6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma8Q9CWH6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma8Q9CWH6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma8Q9CWH6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma8Q9CWH6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma8Q9CWH6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma8Q9CWH6 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma8Q9CWH6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma8Q9CWH6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma8Q9CWH6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma8Q9CWH6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma8Q9CWH6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma8Q9CWH6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma8Q9CWH6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma8Q9CWH6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma8Q9CWH6 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma8Q9CWH6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma8Q9CWH6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma8Q9CWH6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma8Q9CWH6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma8Q9CWH6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma8Q9CWH6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma8Q9CWH6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma8Q9CWH6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma8Q9CWH6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma8Q9CWH6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma8Q9CWH6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma8Q9CWH6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma8Q9CWH6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma8Q9CWH6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma8Q9CWH6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma8Q9CWH6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma8Q9CWH6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma8Q9CWH6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma8Q9CWH6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma8Q9CWH6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma8Q9CWH6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma8Q9CWH6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma8Q9CWH6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma8Q9CWH6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Psma8Q9CWH6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Psma8Q9CWH6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Psma8Q9CWH6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma8Q9CWH6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma8Q9CWH6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma8Q9CWH6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma8Q9CWH6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma8Q9CWH6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma8Q9CWH6 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma8Q9CWH6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma8Q9CWH6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma8Q9CWH6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma8Q9CWH6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma8Q9CWH6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma8Q9CWH6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma8Q9CWH6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma8Q9CWH6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma8Q9CWH6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma8Q9CWH6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma8Q9CWH6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma8Q9CWH6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma8Q9CWH6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma8Q9CWH6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma8Q9CWH6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma8Q9CWH6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma8Q9CWH6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma8Q9CWH6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma8Q9CWH6 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma8Q9CWH6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma8Q9CWH6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma8Q9CWH6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma8Q9CWH6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma8Q9CWH6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma8Q9CWH6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma8Q9CWH6 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma8Q9CWH6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma8Q9CWH6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma8Q9CWH6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma8Q9CWH6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma8Q9CWH6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma8Q9CWH6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma8Q9CWH6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma8Q9CWH6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma8Q9CWH6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma8Q9CWH6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma8Q9CWH6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma8Q9CWH6 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma8Q9CWH6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma8Q9CWH6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma8Q9CWH6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma8Q9CWH6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms