Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NubplQ9CWD8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms