Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV82

2310003L06Rik, RIKEN cDNA 2310003L06 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310003L06RikQ9CV82 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
2310003L06RikQ9CV82 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
2310003L06RikQ9CV82 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
2310003L06RikQ9CV82 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
2310003L06RikQ9CV82 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
2310003L06RikQ9CV82 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2310003L06RikQ9CV82 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
2310003L06RikQ9CV82 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
2310003L06RikQ9CV82 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2310003L06RikQ9CV82 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2310003L06RikQ9CV82 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
2310003L06RikQ9CV82 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2310003L06RikQ9CV82 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2310003L06RikQ9CV82 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2310003L06RikQ9CV82 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
2310003L06RikQ9CV82 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2310003L06RikQ9CV82 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
2310003L06RikQ9CV82 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
2310003L06RikQ9CV82 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2310003L06RikQ9CV82 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
2310003L06RikQ9CV82 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
2310003L06RikQ9CV82 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2310003L06RikQ9CV82 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2310003L06RikQ9CV82 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2310003L06RikQ9CV82 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
2310003L06RikQ9CV82 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2310003L06RikQ9CV82 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2310003L06RikQ9CV82 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2310003L06RikQ9CV82 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2310003L06RikQ9CV82 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2310003L06RikQ9CV82 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2310003L06RikQ9CV82 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2310003L06RikQ9CV82 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16■□□□□ 0.15
2310003L06RikQ9CV82 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2310003L06RikQ9CV82 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2310003L06RikQ9CV82 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2310003L06RikQ9CV82 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms