Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ5

4930524J08Rik, RIKEN cDNA 4930524J08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930524J08RikQ9CUJ5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms