Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcf1Q9CTH6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fcf1Q9CTH6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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