Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms