Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR55

UPF0547 protein C16orf87 homolog, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CR55 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CR55 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CR55 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CR55 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CR55 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CR55 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CR55 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CR55 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CR55 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CR55 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CR55 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CR55 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CR55 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CR55 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CR55 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CR55 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CR55 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CR55 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CR55 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CR55 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CR55 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CR55 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CR55 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CR55 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CR55 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CR55 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CR55 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CR55 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CR55 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CR55 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CR55 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CR55 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CR55 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CR55 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CR55 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CR55 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CR55 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CR55 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CR55 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CR55 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CR55 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CR55 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CR55 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CR55 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CR55 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CR55 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CR55 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CR55 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CR55 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CR55 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CR55 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CR55 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CR55 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CR55 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CR55 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CR55 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CR55 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CR55 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CR55 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CR55 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CR55 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CR55 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CR55 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CR55 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CR55 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CR55 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CR55 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CR55 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CR55 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CR55 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CR55 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CR55 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CR55 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CR55 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CR55 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CR55 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CR55 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CR55 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CR55 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CR55 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CR55 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CR55 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CR55 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CR55 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CR55 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CR55 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CR55 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CR55 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CR55 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CR55 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CR55 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CR55 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CR55 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CR55 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CR55 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CR55 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CR55 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CR55 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CR55 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CR55 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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