Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQU3

Rer1, Protein RER1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rer1Q9CQU3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rer1Q9CQU3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
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