Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT1

Mri1, Methylthioribose-1-phosphate isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mri1Q9CQT1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mri1Q9CQT1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mri1Q9CQT1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms