Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rdm1Q9CQK3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rdm1Q9CQK3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rdm1Q9CQK3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rdm1Q9CQK3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rdm1Q9CQK3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rdm1Q9CQK3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rdm1Q9CQK3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rdm1Q9CQK3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rdm1Q9CQK3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rdm1Q9CQK3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rdm1Q9CQK3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Rdm1Q9CQK3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rdm1Q9CQK3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rdm1Q9CQK3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rdm1Q9CQK3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rdm1Q9CQK3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rdm1Q9CQK3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rdm1Q9CQK3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rdm1Q9CQK3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rdm1Q9CQK3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rdm1Q9CQK3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rdm1Q9CQK3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms