Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ6

Denr, Density-regulated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DenrQ9CQJ6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DenrQ9CQJ6 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms