Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF0

Mrpl11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl11Q9CQF0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrpl11Q9CQF0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrpl11Q9CQF0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrpl11Q9CQF0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrpl11Q9CQF0 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrpl11Q9CQF0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrpl11Q9CQF0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrpl11Q9CQF0 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.7 ms