Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rab5aQ9CQD1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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