Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQC3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQC3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQC3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CQC3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CQC3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CQC3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9CQC3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms