Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC0

Tpbpb, Trophoblast-specific protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpbpbQ9CQC0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TpbpbQ9CQC0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TpbpbQ9CQC0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TpbpbQ9CQC0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TpbpbQ9CQC0 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TpbpbQ9CQC0 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TpbpbQ9CQC0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TpbpbQ9CQC0 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TpbpbQ9CQC0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TpbpbQ9CQC0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TpbpbQ9CQC0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TpbpbQ9CQC0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TpbpbQ9CQC0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TpbpbQ9CQC0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TpbpbQ9CQC0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TpbpbQ9CQC0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TpbpbQ9CQC0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TpbpbQ9CQC0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TpbpbQ9CQC0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TpbpbQ9CQC0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TpbpbQ9CQC0 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TpbpbQ9CQC0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TpbpbQ9CQC0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TpbpbQ9CQC0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TpbpbQ9CQC0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TpbpbQ9CQC0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TpbpbQ9CQC0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TpbpbQ9CQC0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TpbpbQ9CQC0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TpbpbQ9CQC0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TpbpbQ9CQC0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TpbpbQ9CQC0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TpbpbQ9CQC0 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TpbpbQ9CQC0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TpbpbQ9CQC0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TpbpbQ9CQC0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TpbpbQ9CQC0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TpbpbQ9CQC0 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TpbpbQ9CQC0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TpbpbQ9CQC0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TpbpbQ9CQC0 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TpbpbQ9CQC0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TpbpbQ9CQC0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TpbpbQ9CQC0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TpbpbQ9CQC0 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TpbpbQ9CQC0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TpbpbQ9CQC0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TpbpbQ9CQC0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TpbpbQ9CQC0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TpbpbQ9CQC0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TpbpbQ9CQC0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TpbpbQ9CQC0 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TpbpbQ9CQC0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TpbpbQ9CQC0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TpbpbQ9CQC0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TpbpbQ9CQC0 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TpbpbQ9CQC0 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TpbpbQ9CQC0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TpbpbQ9CQC0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TpbpbQ9CQC0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TpbpbQ9CQC0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TpbpbQ9CQC0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TpbpbQ9CQC0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TpbpbQ9CQC0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TpbpbQ9CQC0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TpbpbQ9CQC0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TpbpbQ9CQC0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TpbpbQ9CQC0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TpbpbQ9CQC0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TpbpbQ9CQC0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TpbpbQ9CQC0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TpbpbQ9CQC0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TpbpbQ9CQC0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TpbpbQ9CQC0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TpbpbQ9CQC0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TpbpbQ9CQC0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TpbpbQ9CQC0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TpbpbQ9CQC0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TpbpbQ9CQC0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TpbpbQ9CQC0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TpbpbQ9CQC0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TpbpbQ9CQC0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TpbpbQ9CQC0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TpbpbQ9CQC0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TpbpbQ9CQC0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TpbpbQ9CQC0 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TpbpbQ9CQC0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TpbpbQ9CQC0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TpbpbQ9CQC0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TpbpbQ9CQC0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TpbpbQ9CQC0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TpbpbQ9CQC0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TpbpbQ9CQC0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TpbpbQ9CQC0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TpbpbQ9CQC0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TpbpbQ9CQC0 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TpbpbQ9CQC0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TpbpbQ9CQC0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TpbpbQ9CQC0 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TpbpbQ9CQC0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms