Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp3Q9CQ10 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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