Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms