Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPU1

Ssxb1, MCG116417, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb1Q9CPU1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Ssxb1Q9CPU1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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