Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH8

Trem2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem2Q99NH8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trem2Q99NH8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trem2Q99NH8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trem2Q99NH8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trem2Q99NH8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Trem2Q99NH8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trem2Q99NH8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trem2Q99NH8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trem2Q99NH8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trem2Q99NH8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trem2Q99NH8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trem2Q99NH8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trem2Q99NH8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trem2Q99NH8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trem2Q99NH8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trem2Q99NH8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trem2Q99NH8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trem2Q99NH8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trem2Q99NH8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trem2Q99NH8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trem2Q99NH8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trem2Q99NH8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trem2Q99NH8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms