Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcgf6Q99NA9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms