Protein–RNA interactions for Protein: Q99MX1

Usp26, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 26, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp26Q99MX1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Usp26Q99MX1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp26Q99MX1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp26Q99MX1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp26Q99MX1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp26Q99MX1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp26Q99MX1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp26Q99MX1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp26Q99MX1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp26Q99MX1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp26Q99MX1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp26Q99MX1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp26Q99MX1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp26Q99MX1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp26Q99MX1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp26Q99MX1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp26Q99MX1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp26Q99MX1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp26Q99MX1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp26Q99MX1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp26Q99MX1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp26Q99MX1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms