Protein–RNA interactions for Protein: Q99MS8

Tpgs1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpgs1Q99MS8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpgs1Q99MS8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpgs1Q99MS8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpgs1Q99MS8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpgs1Q99MS8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpgs1Q99MS8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpgs1Q99MS8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpgs1Q99MS8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpgs1Q99MS8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpgs1Q99MS8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpgs1Q99MS8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpgs1Q99MS8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpgs1Q99MS8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpgs1Q99MS8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpgs1Q99MS8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpgs1Q99MS8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpgs1Q99MS8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpgs1Q99MS8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpgs1Q99MS8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpgs1Q99MS8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpgs1Q99MS8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpgs1Q99MS8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpgs1Q99MS8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpgs1Q99MS8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpgs1Q99MS8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpgs1Q99MS8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpgs1Q99MS8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpgs1Q99MS8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tpgs1Q99MS8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tpgs1Q99MS8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tpgs1Q99MS8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tpgs1Q99MS8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tpgs1Q99MS8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tpgs1Q99MS8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tpgs1Q99MS8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tpgs1Q99MS8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tpgs1Q99MS8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tpgs1Q99MS8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tpgs1Q99MS8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tpgs1Q99MS8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tpgs1Q99MS8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tpgs1Q99MS8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tpgs1Q99MS8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tpgs1Q99MS8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tpgs1Q99MS8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tpgs1Q99MS8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tpgs1Q99MS8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tpgs1Q99MS8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tpgs1Q99MS8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tpgs1Q99MS8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tpgs1Q99MS8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tpgs1Q99MS8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpgs1Q99MS8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpgs1Q99MS8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpgs1Q99MS8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpgs1Q99MS8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpgs1Q99MS8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpgs1Q99MS8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpgs1Q99MS8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpgs1Q99MS8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpgs1Q99MS8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpgs1Q99MS8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpgs1Q99MS8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpgs1Q99MS8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpgs1Q99MS8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpgs1Q99MS8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpgs1Q99MS8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpgs1Q99MS8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpgs1Q99MS8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpgs1Q99MS8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpgs1Q99MS8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpgs1Q99MS8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpgs1Q99MS8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tpgs1Q99MS8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpgs1Q99MS8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpgs1Q99MS8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tpgs1Q99MS8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpgs1Q99MS8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tpgs1Q99MS8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpgs1Q99MS8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpgs1Q99MS8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tpgs1Q99MS8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpgs1Q99MS8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Tpgs1Q99MS8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tpgs1Q99MS8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tpgs1Q99MS8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpgs1Q99MS8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpgs1Q99MS8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpgs1Q99MS8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpgs1Q99MS8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpgs1Q99MS8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpgs1Q99MS8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpgs1Q99MS8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpgs1Q99MS8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpgs1Q99MS8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpgs1Q99MS8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpgs1Q99MS8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpgs1Q99MS8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpgs1Q99MS8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpgs1Q99MS8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms