Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms