Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
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Sh3bp5lQ99LH9 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sh3bp5lQ99LH9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sh3bp5lQ99LH9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sh3bp5lQ99LH9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sh3bp5lQ99LH9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
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Sh3bp5lQ99LH9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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Sh3bp5lQ99LH9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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Sh3bp5lQ99LH9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
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Sh3bp5lQ99LH9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sh3bp5lQ99LH9 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sh3bp5lQ99LH9 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sh3bp5lQ99LH9 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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Sh3bp5lQ99LH9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sh3bp5lQ99LH9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sh3bp5lQ99LH9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sh3bp5lQ99LH9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sh3bp5lQ99LH9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sh3bp5lQ99LH9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sh3bp5lQ99LH9 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sh3bp5lQ99LH9 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Sh3bp5lQ99LH9 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sh3bp5lQ99LH9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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Sh3bp5lQ99LH9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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Sh3bp5lQ99LH9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
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Sh3bp5lQ99LH9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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Sh3bp5lQ99LH9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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Sh3bp5lQ99LH9 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp5lQ99LH9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms