Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms