Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lactb2Q99KR3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lactb2Q99KR3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lactb2Q99KR3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lactb2Q99KR3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lactb2Q99KR3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lactb2Q99KR3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lactb2Q99KR3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lactb2Q99KR3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lactb2Q99KR3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lactb2Q99KR3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lactb2Q99KR3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lactb2Q99KR3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lactb2Q99KR3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lactb2Q99KR3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lactb2Q99KR3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lactb2Q99KR3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lactb2Q99KR3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lactb2Q99KR3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lactb2Q99KR3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lactb2Q99KR3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lactb2Q99KR3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lactb2Q99KR3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lactb2Q99KR3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lactb2Q99KR3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lactb2Q99KR3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lactb2Q99KR3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lactb2Q99KR3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lactb2Q99KR3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lactb2Q99KR3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lactb2Q99KR3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lactb2Q99KR3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lactb2Q99KR3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lactb2Q99KR3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lactb2Q99KR3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lactb2Q99KR3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lactb2Q99KR3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lactb2Q99KR3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lactb2Q99KR3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lactb2Q99KR3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lactb2Q99KR3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lactb2Q99KR3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lactb2Q99KR3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lactb2Q99KR3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lactb2Q99KR3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lactb2Q99KR3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lactb2Q99KR3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lactb2Q99KR3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lactb2Q99KR3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lactb2Q99KR3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lactb2Q99KR3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lactb2Q99KR3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lactb2Q99KR3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lactb2Q99KR3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lactb2Q99KR3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lactb2Q99KR3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lactb2Q99KR3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lactb2Q99KR3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lactb2Q99KR3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lactb2Q99KR3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lactb2Q99KR3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lactb2Q99KR3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lactb2Q99KR3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lactb2Q99KR3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lactb2Q99KR3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lactb2Q99KR3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lactb2Q99KR3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lactb2Q99KR3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lactb2Q99KR3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lactb2Q99KR3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lactb2Q99KR3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lactb2Q99KR3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lactb2Q99KR3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lactb2Q99KR3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lactb2Q99KR3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lactb2Q99KR3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lactb2Q99KR3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lactb2Q99KR3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lactb2Q99KR3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lactb2Q99KR3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lactb2Q99KR3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lactb2Q99KR3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lactb2Q99KR3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lactb2Q99KR3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lactb2Q99KR3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lactb2Q99KR3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lactb2Q99KR3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lactb2Q99KR3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lactb2Q99KR3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lactb2Q99KR3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lactb2Q99KR3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lactb2Q99KR3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lactb2Q99KR3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lactb2Q99KR3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lactb2Q99KR3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lactb2Q99KR3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lactb2Q99KR3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lactb2Q99KR3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lactb2Q99KR3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lactb2Q99KR3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms