Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn2aQ99KJ0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn2aQ99KJ0 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn2aQ99KJ0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn2aQ99KJ0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn2aQ99KJ0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn2aQ99KJ0 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn2aQ99KJ0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn2aQ99KJ0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn2aQ99KJ0 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn2aQ99KJ0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn2aQ99KJ0 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn2aQ99KJ0 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn2aQ99KJ0 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn2aQ99KJ0 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn2aQ99KJ0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn2aQ99KJ0 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn2aQ99KJ0 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn2aQ99KJ0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn2aQ99KJ0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn2aQ99KJ0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn2aQ99KJ0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn2aQ99KJ0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn2aQ99KJ0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms