Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Dok4Q99KE3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms