Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlgn1Q99K10 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Nlgn1Q99K10 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms