Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddb2Q99J79 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ddb2Q99J79 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ddb2Q99J79 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ddb2Q99J79 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ddb2Q99J79 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ddb2Q99J79 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ddb2Q99J79 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ddb2Q99J79 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ddb2Q99J79 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ddb2Q99J79 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ddb2Q99J79 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ddb2Q99J79 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ddb2Q99J79 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ddb2Q99J79 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ddb2Q99J79 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ddb2Q99J79 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ddb2Q99J79 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ddb2Q99J79 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ddb2Q99J79 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms