Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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