Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms