Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms