Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms