Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y07

Pcdhb12, MCG141300, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb12Q91Y07 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcdhb12Q91Y07 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcdhb12Q91Y07 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcdhb12Q91Y07 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcdhb12Q91Y07 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcdhb12Q91Y07 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcdhb12Q91Y07 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcdhb12Q91Y07 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcdhb12Q91Y07 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcdhb12Q91Y07 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcdhb12Q91Y07 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcdhb12Q91Y07 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcdhb12Q91Y07 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcdhb12Q91Y07 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcdhb12Q91Y07 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcdhb12Q91Y07 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pcdhb12Q91Y07 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pcdhb12Q91Y07 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Pcdhb12Q91Y07 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pcdhb12Q91Y07 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pcdhb12Q91Y07 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pcdhb12Q91Y07 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcdhb12Q91Y07 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms