Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hps3Q91VB4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hps3Q91VB4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hps3Q91VB4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hps3Q91VB4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hps3Q91VB4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms