Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 AV099323-201ENSMUST00000124336 921 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppargc1bQ8VHJ7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms