Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEM1

Rnf130, E3 ubiquitin-protein ligase RNF130, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf130Q8VEM1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf130Q8VEM1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms