Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE97

Srsf4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf4Q8VE97 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srsf4Q8VE97 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srsf4Q8VE97 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srsf4Q8VE97 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srsf4Q8VE97 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srsf4Q8VE97 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srsf4Q8VE97 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srsf4Q8VE97 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srsf4Q8VE97 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srsf4Q8VE97 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srsf4Q8VE97 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srsf4Q8VE97 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srsf4Q8VE97 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srsf4Q8VE97 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srsf4Q8VE97 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srsf4Q8VE97 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srsf4Q8VE97 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srsf4Q8VE97 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srsf4Q8VE97 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srsf4Q8VE97 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srsf4Q8VE97 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srsf4Q8VE97 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srsf4Q8VE97 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srsf4Q8VE97 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srsf4Q8VE97 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srsf4Q8VE97 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srsf4Q8VE97 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srsf4Q8VE97 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srsf4Q8VE97 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srsf4Q8VE97 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srsf4Q8VE97 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srsf4Q8VE97 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srsf4Q8VE97 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srsf4Q8VE97 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srsf4Q8VE97 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srsf4Q8VE97 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srsf4Q8VE97 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srsf4Q8VE97 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srsf4Q8VE97 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srsf4Q8VE97 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srsf4Q8VE97 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srsf4Q8VE97 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Srsf4Q8VE97 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Srsf4Q8VE97 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Srsf4Q8VE97 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Srsf4Q8VE97 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Srsf4Q8VE97 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Srsf4Q8VE97 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Srsf4Q8VE97 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Srsf4Q8VE97 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Srsf4Q8VE97 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Srsf4Q8VE97 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srsf4Q8VE97 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srsf4Q8VE97 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srsf4Q8VE97 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Srsf4Q8VE97 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srsf4Q8VE97 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srsf4Q8VE97 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srsf4Q8VE97 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srsf4Q8VE97 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srsf4Q8VE97 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srsf4Q8VE97 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srsf4Q8VE97 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srsf4Q8VE97 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srsf4Q8VE97 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srsf4Q8VE97 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srsf4Q8VE97 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srsf4Q8VE97 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf4Q8VE97 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf4Q8VE97 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf4Q8VE97 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf4Q8VE97 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf4Q8VE97 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf4Q8VE97 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf4Q8VE97 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf4Q8VE97 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf4Q8VE97 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf4Q8VE97 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf4Q8VE97 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf4Q8VE97 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf4Q8VE97 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf4Q8VE97 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf4Q8VE97 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf4Q8VE97 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf4Q8VE97 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf4Q8VE97 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf4Q8VE97 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf4Q8VE97 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf4Q8VE97 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf4Q8VE97 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf4Q8VE97 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf4Q8VE97 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srsf4Q8VE97 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srsf4Q8VE97 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srsf4Q8VE97 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srsf4Q8VE97 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srsf4Q8VE97 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srsf4Q8VE97 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srsf4Q8VE97 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srsf4Q8VE97 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms