Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8VDP2 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8VDP2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8VDP2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8VDP2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8VDP2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8VDP2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8VDP2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8VDP2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms