Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc6a20aQ8VDB9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc6a20aQ8VDB9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc6a20aQ8VDB9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Slc6a20aQ8VDB9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms