Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCY6

Utp6, U3 small nucleolar RNA-associated protein 6 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp6Q8VCY6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp6Q8VCY6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Utp6Q8VCY6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Utp6Q8VCY6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Utp6Q8VCY6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Utp6Q8VCY6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Utp6Q8VCY6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Utp6Q8VCY6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Utp6Q8VCY6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp6Q8VCY6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms